Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GDF6Q6KF10 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDF6Q6KF10 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDF6Q6KF10 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms