Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LETM2Q2VYF4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LETM2Q2VYF4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LETM2Q2VYF4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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