Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM1Q16610 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM1Q16610 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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