Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA6Q15825 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNA6Q15825 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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