Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HERC1Q15751 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERC1Q15751 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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