Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BECN1Q14457 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
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BECN1Q14457 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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BECN1Q14457 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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BECN1Q14457 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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BECN1Q14457 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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BECN1Q14457 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BECN1Q14457 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BECN1Q14457 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BECN1Q14457 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BECN1Q14457 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BECN1Q14457 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.55■■■□□ 2
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