Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN12Q05209 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN12Q05209 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN12Q05209 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms