Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CRB1P82279 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CRB1P82279 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CRB1P82279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CRB1P82279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CRB1P82279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRB1P82279 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CRB1P82279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRB1P82279 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CRB1P82279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CRB1P82279 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CRB1P82279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRB1P82279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRB1P82279 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CRB1P82279 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
CRB1P82279 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CRB1P82279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CRB1P82279 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CRB1P82279 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CRB1P82279 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRB1P82279 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CRB1P82279 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CRB1P82279 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CRB1P82279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRB1P82279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRB1P82279 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CRB1P82279 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CRB1P82279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CRB1P82279 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CRB1P82279 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CRB1P82279 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms