Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSBP2P81877 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms