Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTENP60484 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTENP60484 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTENP60484 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTENP60484 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTENP60484 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTENP60484 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTENP60484 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTENP60484 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTENP60484 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTENP60484 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTENP60484 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTENP60484 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTENP60484 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTENP60484 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTENP60484 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTENP60484 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTENP60484 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTENP60484 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTENP60484 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTENP60484 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTENP60484 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTENP60484 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTENP60484 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTENP60484 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTENP60484 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTENP60484 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTENP60484 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms