Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSCP56915 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSCP56915 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSCP56915 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSCP56915 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSCP56915 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSCP56915 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSCP56915 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSCP56915 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSCP56915 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSCP56915 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSCP56915 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSCP56915 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSCP56915 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms