Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPHB3P54753 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPHB3P54753 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EPHB3P54753 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms