Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA3P52797 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms