Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GATMP50440 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GATMP50440 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GATMP50440 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATMP50440 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATMP50440 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATMP50440 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GATMP50440 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATMP50440 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GATMP50440 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATMP50440 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GATMP50440 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GATMP50440 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATMP50440 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATMP50440 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATMP50440 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATMP50440 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATMP50440 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATMP50440 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GATMP50440 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GATMP50440 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATMP50440 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATMP50440 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms