Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIK3CAP42336 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3CAP42336 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3CAP42336 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms