Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YY1P25490 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YY1P25490 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YY1P25490 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YY1P25490 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YY1P25490 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YY1P25490 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YY1P25490 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YY1P25490 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YY1P25490 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
YY1P25490 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
YY1P25490 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YY1P25490 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YY1P25490 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
YY1P25490 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
YY1P25490 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YY1P25490 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YY1P25490 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
YY1P25490 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YY1P25490 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YY1P25490 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
YY1P25490 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YY1P25490 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
YY1P25490 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
YY1P25490 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
YY1P25490 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
YY1P25490 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
YY1P25490 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YY1P25490 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
YY1P25490 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
YY1P25490 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YY1P25490 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YY1P25490 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YY1P25490 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
YY1P25490 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
YY1P25490 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
YY1P25490 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms