Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TRHP20396 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRHP20396 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRHP20396 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRHP20396 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TRHP20396 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TRHP20396 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TRHP20396 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TRHP20396 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TRHP20396 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TRHP20396 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRHP20396 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRHP20396 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRHP20396 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TRHP20396 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRHP20396 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRHP20396 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRHP20396 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRHP20396 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TRHP20396 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TRHP20396 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRHP20396 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRHP20396 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRHP20396 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRHP20396 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TRHP20396 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRHP20396 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRHP20396 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRHP20396 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRHP20396 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
TRHP20396 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRHP20396 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRHP20396 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRHP20396 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TRHP20396 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRHP20396 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TRHP20396 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
TRHP20396 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRHP20396 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRHP20396 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRHP20396 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRHP20396 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TRHP20396 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TRHP20396 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
TRHP20396 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRHP20396 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TRHP20396 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TRHP20396 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRHP20396 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRHP20396 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRHP20396 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRHP20396 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TRHP20396 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TRHP20396 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRHP20396 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
TRHP20396 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRHP20396 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRHP20396 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TRHP20396 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRHP20396 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRHP20396 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TRHP20396 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms