Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACADSP16219 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACADSP16219 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACADSP16219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACADSP16219 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACADSP16219 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACADSP16219 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACADSP16219 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACADSP16219 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSP16219 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSP16219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSP16219 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSP16219 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACADSP16219 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACADSP16219 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms