Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRG2P13727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRG2P13727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRG2P13727 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRG2P13727 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRG2P13727 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRG2P13727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRG2P13727 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRG2P13727 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRG2P13727 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRG2P13727 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRG2P13727 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRG2P13727 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRG2P13727 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRG2P13727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRG2P13727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms