Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEACAM1P13688 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEACAM1P13688 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEACAM1P13688 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms