Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB1P11230 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHRNB1P11230 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms