Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxb7P09024 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxb7P09024 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxb7P09024 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms