Protein–RNA interactions for Protein: O95390

GDF11, Growth/differentiation factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF11O95390 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF11O95390 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF11O95390 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF11O95390 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDF11O95390 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF11O95390 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF11O95390 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF11O95390 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF11O95390 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GDF11O95390 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GDF11O95390 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDF11O95390 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF11O95390 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF11O95390 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF11O95390 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GDF11O95390 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF11O95390 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF11O95390 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GDF11O95390 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GDF11O95390 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GDF11O95390 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GDF11O95390 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDF11O95390 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GDF11O95390 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF11O95390 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF11O95390 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF11O95390 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GDF11O95390 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GDF11O95390 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GDF11O95390 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms