Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAPSS1O43252 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms