Protein–RNA interactions for Protein: O15126

SCAMP1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1O15126 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCAMP1O15126 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAMP1O15126 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAMP1O15126 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms