Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zfp708F8VPP0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp708F8VPP0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms