Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ18B7U540 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNJ18B7U540 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ18B7U540 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms