Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
B4DEV8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DEV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DEV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DEV8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DEV8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
B4DEV8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
B4DEV8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
B4DEV8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
B4DEV8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
B4DEV8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
B4DEV8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
B4DEV8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DEV8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DEV8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DEV8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms