Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
A4D1N5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4D1N5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4D1N5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4D1N5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
A4D1N5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A4D1N5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A4D1N5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A4D1N5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A4D1N5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A4D1N5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A4D1N5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4D1N5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A4D1N5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms