Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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