Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms