Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms