Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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