Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SCN9AQ15858 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN9AQ15858 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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