Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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NCOA1Q15788 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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NCOA1Q15788 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCOA1Q15788 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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