Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM28Q13263 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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