Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEC13P55735 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEC13P55735 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEC13P55735 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms