Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK8P49336 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK8P49336 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK8P49336 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDK8P49336 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK8P49336 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK8P49336 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms