Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARL1P40616 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARL1P40616 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARL1P40616 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARL1P40616 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARL1P40616 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms