Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5C1P36542 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms