Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms