Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRCP08575 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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PTPRCP08575 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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