Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PPFIA3O75145 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms