Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLGNO14967 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms