Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms