Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HDGFL3Q9Y3E1 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms