Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms