Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRPC4Q9UBN4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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