Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN3Q9P232 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN3Q9P232 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms