Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHST12Q9NRB3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms